孝莊祕史八旗旗主分別是

努爾哈赤時期，為上兩旗，分別為正黃旗，和鑲黃旗。這上兩旗的旗主為努爾哈赤和大福晉阿巴亥的幼子，正黃旗旗主多鐸，鑲黃旗旗主為阿濟格和多爾袞。

他們三人名義上領有兩旗，但實際上是努爾哈赤控制。其他下六旗主分別為，正白旗旗主皇太極，鑲白旗旗主杜度（努爾哈赤孫子），正藍旗旗主莽古爾泰和德格類（一母同胞兄弟），鑲藍旗旗主為阿敏和吉爾哈朗，正紅旗旗主代善，鑲紅旗旗主嶽拖（代善的兒子）。