酵母表達系統的優缺點

優點：克服大腸桿菌表達系統的不足，能繁殖快，高密度發酵，可以進行蛋白質翻譯後的修飾合加工。

缺點：缺乏強有力的受嚴格調控的啟動子，分泌效率低，尤其是對於分子質量大於30KD的目的蛋白分子幾乎不分泌。不適於高密度培養。

甲醇酵母表達系統：具有翻譯後加工的功能，有適合真核生物基因產物正確摺疊的細胞內環境和糖鏈加工系統。還能分泌目的基因產物導培養液中，有利於純化等。

酵母表達系統兼有原核和高等真核系統的優點，具備培養條件普通、生長速度快、成本相對較低、能進行蛋白翻譯後加工、易獲得可溶性活性重組蛋白等特點，被廣泛用於重組蛋白尤其是真核蛋白的生產製備。

其中巴斯德畢赤酵母（Pichia pastoris）因其生長速度快、商業化表達載體豐富、可獲得高效的分泌表達等優點，使其成為酵母表達重組蛋白的優先選擇。