代謝工程育種常採用的方法包括

①改變代謝途徑

②擴展代謝途徑

③構建新的代謝途徑。

代謝工程育種這是一種利用基因工程技術對微生物代謝網絡中特定代謝途徑進行有精確目標的基因操作，改變微生物原有的調節系統，使目的代謝產物的活性或產量得到大幅度提高的一種育種技術。根據微生物不同代謝特徵，一般採用改變代謝途徑、擴展代謝途徑以及構建新的代謝途徑等方法來達到目的。