革蘭染色法三大學説

革蘭氏染色原理目前有三種觀點：等電點學説、化學學説和滲透學説。

等電點學説

革蘭氏陽性菌的等電點在pH2-3，比陰性菌（pH4-5）低，加之碘為弱氧化劑，可降低革蘭氏陽性菌的等電點，致使兩類菌的等電點差異擴大，因此陽性菌和鹼性染料的結合力比陰性菌更強。

化學學説

碘液在菌體內與結晶紫結合後又和菌體內核糖核酸鎂鹽-蛋白質複合物結合，此結合物不易被丙酮酒精脱掉，呈革蘭氏染色陽性。因革蘭氏陰性菌缺乏核糖核酸鎂鹽，故對碘與結晶紫結合物攝取少，且不牢固，易被丙酮酒精脱色而呈革蘭氏染色陰性。

滲透學説

乙醇使陽性菌所含粘肽多糖脱水而致細胞壁間隙縮小，通透性降低，在菌體內保留了染料-碘複合物，呈紫色。陰性菌含粘肽少，細胞壁變化不大，通透性不受影響，菌體內的染料-碘複合物較易透出，失去紫色，被複染成為紅色。